公費流感及新冠疫苗今(10/1)天同步開打，第一階段開放65歲以上長者、55歲以上原住民、學齡前幼兒、孕婦、高風險族群、醫事及防疫人員、長照機構人員等對象接種；第二階段自11月2日起開放50至64歲無高風險慢性病成人。
目前流感疫情仍處流行期，疾管署預估這波高峰單週類流感就診人次可能上看15萬，呼籲符合資格民眾及早接種。全台近4千家合約院所提供施打服務，台北、新北、台中、台南同步推出加碼措施，年滿18歲民眾接種流感、新冠疫苗可分別獲得450、900健康幣，「左流右新」一次完成最高可累積1,350健康幣。
根據疾管署最新監測，第38週(9月20日至26日)全國類流感門急診就診達13萬8,654人次，較前一週下降3.2%，目前疫情呈持平但仍處流行期；9月22日至28日新增87例流感併發重症及30例死亡。本流感季累計1,673例重症、334例死亡，重症以65歲以上長者及具有慢性病史者居多，其中67.7%未接種本季流感疫苗。
新冠疫情則呈下降趨勢，但也在流行期，第38週門急診就診1萬502人次，較前週下降28.4%；9月22日至28日新增33例本土重症及14例死亡。疾管署指出，流感目前社區流行病毒以A型為主，其中H1N1占比最高，符合資格民眾應把握疫苗開打時程。
今(2026)年公費疫苗分兩階段實施，第一階段包括65歲以上長者、55歲以上原住民、安養及長照機構受照顧者與工作人員、滿6個月至國小入學前幼兒、孕婦、具潛在疾病者、6個月內嬰兒的雙親或實際扶養者、醫事及衛生防疫人員、幼兒園及托育機構人員等；流感疫苗另涵蓋國高中學生及禽畜、動物防疫人員。新冠疫苗對幼兒的條件則為滿6個月至未滿6歲且從未接種新冠疫苗者。第二階段自11月2日起，流感及新冠疫苗開放50至64歲無高風險慢性病成人接種。
今年全國公費流感疫苗採購705萬150劑，並首度提供免疫加強型流感疫苗，優先供長照及安養機構65歲以上長者使用；新冠疫苗則全面升級新世代疫苗。民眾可至合約院所、衛生所或接種站施打，須攜帶健保卡及相關證明文件。
台北市首日由市長蔣萬安、衛生局長黃建華及藝人檢場響應「左流右新」，號召醫事公會與12區健康服務中心推廣接種。符合資格的設籍台北市民，10月1日至11月30日在北市合約院所或接種站完成公費流感或新冠疫苗，可參加抽獎，每接種1劑增加1次機會，同日完成兩種疫苗再多1次，獎項包括iPhone 17、空氣清淨機、液晶顯示器及家電禮券等。
新北市祭出「流感新冠作伙打，新北長者抽大獎」，65歲以上市民自10月1日至12月31日接種流感或新冠疫苗即可參加抽獎，同時接種兩種疫苗可增加中獎機會，獎項包含黃金及禮券。台中市同步開打，校園接種預計10月底前完成，另提供滿6個月至6歲幼兒及65歲以上長者預約服務。台南市透過衛生所、醫療院所及社區接種站提供服務，並建置疫苗接種預約系統，方便民眾查詢及預約。
今年另一項亮點是「健康幣」10月1日起正式上路。年滿18歲民眾完成指定健康任務即可累積健康幣，其中接種流感疫苗可獲450幣、新冠疫苗900幣、肺炎鏈球菌疫苗600幣，若同時完成流感及新冠疫苗接種，即可獲得1,350健康幣，12月1日起可兌換健康商品。