許多實行體重控制或是不習慣飲用純水的人，經常將檸檬水當成日常水分的來源，然而營養師李婉萍特別提出警告，如果飲用方式錯誤，不僅無法順利瘦身，甚至可能對消化道造成嚴重傷害，過去就曾有減肥者將高濃度的檸檬水當成開水猛灌，最終導致胃穿孔而緊急送醫。
檸檬本身具備極高的酸度與強烈刺激性，如果本身已經患有胃潰瘍或胃食道逆流等疾病，千萬不能在空腹狀態下大量飲用，這無異於反覆刺激脆弱且受傷的胃壁。營養師指出，雖然適度攝取檸檬能夠促進胃酸分泌、改善消化機能並提升新陳代謝，對於不愛喝白開水的人來說也能增加口感與水分攝取，但前提是必須掌握正確的飲用原則，以免養生不成反而傷身。
為了在享受檸檬水好處的同時避免健康風險，營養師李婉萍提出三項具體建議。第一是飲用時間點務必選擇在飯後進行，藉此減少空腹受酸液直接侵蝕的機會。第二是沖泡時一定要加水充分稀釋，降低整體的酸度。第三則是嚴格控制分量，每天使用的檸檬總量絕對不要超過1顆，透過正確且適量的攝取方式，才能在追求健康與體態的道路上走得長遠。
除了腸胃道可能面臨的刺激與傷害之外，牙科醫師與營養專家也提醒，由於檸檬汁的酸性物質容易侵蝕牙齒表面的琺瑯質，長期直接飲用可能導致牙齒敏感或變黃。建議民眾在飲用稀釋檸檬水時，盡量使用吸管來減少液體與牙齒的接觸面積，並在飲用完畢後立即用清水漱口，切忌馬上刷牙，以免在琺瑯質軟化的狀態下反而加劇磨損，落實細節才能兼顧瘦身與口腔健康。