2024年底，台中科技大學校長推薦為公共工程委員會採購評選委員的鄭姓教授，遭人投訴媒體，指其「性侵」女職員；事實上，鄭僅牽涉「性別工作平等法」案件，與性侵天差地遠，且內容也只是因為有人在校級會議散發資料，提及校長的私人廁所有秘書的衛生棉，鄭男因為擔任主管，慘遭牽連；而這起惡意抹黑導因於前後任校長的鬥爭！
該校人士指出，2024年某知名媒體大肆報導台中科技大學醜聞，記者指出，該校B教授控校長陳同孝「推薦一名性侵女職員的鄭姓教師，擔任行政院公共工程委員會的採購評選委員，教育部得知後，已在今年5月令校方循程序撤回推薦」。
這明顯是拿錯誤資料誤導媒體，這名鄭姓教授從未「性侵」女職員，而是涉入一起「性別工作平等法」案件，且法院也作出判決，但媒體不察，將他寫成性侵犯，實在冤枉。
該校F姓職員透露，當時是前校長謝俊宏任內，有次召開校級會議，會中林姓教授因為「空中學院」院長被拔掉，心中不爽，在會場拿出一個牛皮紙袋，散發黑函。
黑函內容指控校長辦公室裡的私人廁所，放有一名W姓女秘書的衛生棉，影射兩人有「難以解釋」的親密關係。林姓教授的行為當場被制止，這份文件也被勒令收回，並未對外流出，問題來了，事後林姓教授一口咬定，這些黑函是時任主任秘書的鄭姓教授提供。
W姓秘書認為，鄭教唆林散發黑函，影射她與校長有不正當關係，不但提申訴，還告到法院，最後雖然鄭姓教授教唆證據不足，但因為此事發生在職場裡，違反「性別工作平等法」，且鄭男當時是主任秘書，又被咬死，因此法官判他必須賠償W秘書與謝校長各十萬元台幣。
謝男在這場散佈黑函的會議結束後，隔日就辭去主任秘書職務，沒想到吃上官司，事過境遷還被媒體寫成性侵犯。校內人士透露，這場風波會在2024年年底，繼任校長陳同孝上任後，被以誤導方式爆料給媒體，其實是兩名前後任校長的鬥爭。
另一校內人士指出，前後任校長原本「肝膽相照」，陳同孝是在謝俊宏力挺之下，才高票當選校長，沒想到為了謝校長的林姓愛徒，與繼任者翻臉了！據了解，謝前校長強力要求陳同孝，將其愛徒林女聘任為專任助理教授，但繼任的陳校長堅持只能聘為「專案教師」，接著得「看她自己的表現」。
在台中科大兼任的林姓女教師，獲聘專案教師，已經羨煞不少兼職教師，但她仍得面對六年內若沒獲聘專任教師就必須離職的壓力，專任與專案只差一字，但待遇天差地別，校內人士指出，林女直接聘為專任助理教授，雖不違法，但校長很難對校內許多等待聘書的專案教師交代。
校內人士指出，為了愛徒，前後任校長人馬在校內鬥得天翻地覆，向媒體投書不止一次，前幾次都還有些事實根據，只是誇大其嚴重性、刻意不講某些事實，但這次誣指鄭姓教授「性侵」，根本是惡搞，已經沒有底線了。
中科大校長陳同孝回應表示：「近年來，不斷有校內人士企圖透過媒體曝光機會，刻意扭曲事實，做出傷害學校校譽之事，對於此種花費大量心力對付學校，置對外的目標或威脅於不顧的行為，外界以內鬥形容，但個人將其視為內耗，也就是內耗，更令人痛心。」陳同孝強調，他禁得起輿論的監督，未忘做一位照亮學校價值之校長的承諾。
中科大護理系表示，該系實習臨床指導教師之進用，均依《國立臺中科技大學校務基金進用實習臨床指導教師管理要點》及相關規定辦理；由用人單位組成甄選小組，本公平、公正、公開原則辦理甄選，再簽陳校長進用，並非由系主任個人決定聘任。
至於陳姓副教授遭控曾以升等問題「恐嚇」其他教師一節，迫使其同意當學生，其指控內容與該校教師升等之制度及實際審查程序並不相符；如有具體事證，自應由學校依相關程序查明。