行政院長卓榮泰聲稱，因立法院刪減預算，南部豪雨期間「只能用電話跟地方聯繫」。在野陣營二十四日質疑，兩個月前總預算還沒通過，「卓榮泰難道是用走的去勘災嗎？」對此，卓榮泰回應，「該聯繫的我們都已經聯繫了」。
國民黨文傳會主委陳以信指出，今年中央政府總預算已通過，政府有災害準備金、第二預備金可供緊急需要；《災害防救法》更明定，災害防救經費不敷時可以調整當年度收支「移緩濟急」。
今年稅收超收數千億元，政府財源非常充裕，卓榮泰竟然怪「沒錢勘災、只能打電話」，根本是在拿災民當政治鬥爭工具。
他表示，民進黨執政多年，中央地方砸下龐大治水經費，台南、高雄卻仍一淹再淹。現在出了災情不檢討治水成效，反而第一時間怪立法院刪預算，「不會治水、不會救災，只會亂花錢、甩鍋國會，這樣的行政院還要人民養來做什麼？」卓榮泰如果真的覺得勘災這麼困難，「乾脆下台一鞠躬，大家都比較輕鬆」。
國民黨立院黨團書記長林沛祥表示，根據水利署以及相關統計資料，歷年中央治水相關特別計畫累計，台南市約四百六十六億元、高雄市約二百七十九億元，換來的「拿的越多，淹的越慘」，只要綠營執政縣市大淹水就只會甩鍋轉移焦點，真正的拿著金飯碗假裝乞丐。
立委王鴻薇也痛批卓榮泰說謊不打草稿，指行政院第二預備金高達八十億元，勘災綽綽有餘。
民眾黨主席黃國昌指出，行政官員有錢有閒四處替民進黨縣市長候選人站台輔選，南部水災時卻高喊沒錢勘災，這種說法簡直是在汙辱台灣公民社會的智商。如果按照行政院的邏輯，兩個月前總預算還沒通過，「卓榮泰是如何去勘災的？難道是用走的嗎？」
他表示，民進黨政府投入上千億預算治水，每逢大雨人民依舊苦不堪言。民進黨及卓榮泰找不到理由可以卸責，不但不思反省，反而繼續為自己的無能找藉口，未免也太難看了吧。
對於在野黨質疑，卓榮泰只表示，「該聯繫的我們都已經聯繫了」。行政院發言人李慧芝則指出，立法院大幅刪減中央政府相關預算，行政院原用於支應院長因應天災、赴各地災區勘災及推動災後復原工作的「施政推展聯繫費」遭刪減九成、約五百五十三萬餘元，也因此卓榮泰現階段在災害應變期間的相關行程受到限制。