國民黨立委翁曉玲因行政院長卓榮泰不副署立法院通過的8個法案，提案凍結他9到12月的薪資，但賴清德總統9月18日表示，憲法保障服公職的工作權，人事費用是法定經費，立法院不宜刪減或凍結。對於卓揆薪水是否已入帳？行政院發言人李慧芝今（24）日在院會後記者會表示，會審慎處理。
115年度總預算案於8月14日在立法院三讀通過，翁曉玲提案凍結卓榮泰9至12月薪水，全數刪除黨產會政務人員待遇262萬9000元。賴總統18日公告115年度總預算時，批示法定人事費不宜刪凍，黨產會主委林峯正20日證實主計總處已「開綠燈」，讓立法院凍結閣揆與官員薪資的提案無法落實，外界好奇卓榮泰的薪水是否入帳。
對此，李慧芝表示，依照憲法第 54條與行政院組織法第10條第1項規定，行政院長的法定職務受到憲法公職權與工作權的雙重保障，其他法規所規定的政務人員同樣也有法律保障。
李慧芝指出，行政院長與相關政務人員的俸給，依照「全國軍公教人員待遇支給要點」，也就是「預算法」所規定的法定經費。立法院動用決議方式，凍結閣揆薪資，等於是透過年度預算案的審議，來影響閣揆行使行政職權，此違反釋字第601號解釋，逾越立法院的權限，也違反權力分立原則，且違反預算法第 51 條第一項但書的規定。
李慧芝說，預算法第51條第一項但書，規定法定預算附加條件或期限者從其所規定，但該條件或期限為法律所不許者不在此限。行政院會依法行政，依照總統的批示，請主計總處研議，立法院違法違憲刪除或凍結政務人員薪資的後續處置，會審慎處理。
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